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作为反恐对策的环节之一，法务省入国管理局的“出入境管理与难民认定法”修正案于5月17日上午在参院全体会议上以执政党等的多数赞成获得通过并正式成立。其中规定16岁以上外国人在出入境时需登记指纹。同时还规定，法务大臣认定的恐怖主义者，相关部门可将其强制驱逐出境。该修正案预计将从明年秋季开始实施。
早在2004年年底，日本政府国际组织犯罪及国际恐怖活动对策推进总部决定了实施新增采取指纹等的《关于防范恐怖活动的行动计划》。在去年6月8日，日本政府及自民党决定，作为防止外国人犯罪措施的一环，将规定外国人在出入境时有义务登记指纹。不过在日韩国人、朝鲜人等拥有“特别永住权”的人不在此列。该方针是在自民党本部举行的非法居留者对策强化小委员会上获得认可的。随后在6月28日首相官邸召开的犯罪对策内阁成员会议与城市再生总部的合并会议上，就规定入境外国公民（特别永住者除外）有义务接受指纹采取和拍摄脸部照片的新入境管理制度展开了具体讨论，并决定在2006年的通常国会上提交《出入国管理及难民认定法》修正案。
该修正案规定外国人在入境时必须提供指纹和脸部照片等“个人识别信息”。作为例外，以下人士可以免于提供指纹：1、在日韩国、朝鲜人等拥有“特别永住权”的人不在此列；2、未满16岁；3、因外交、公务赴日者；4、应政府邀请访日者。
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